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云南省优势中药材规范化种植工程研究中心在国际刊物上发表系列论文
作者:柳青 来源:供稿 时间:2016-06-15浏览次数:

      本站消息   近期,我校云南省优势中药材规范化种植工程研究中心联合昆明理工大学和中科院昆明动物研究所成功完成了丹参的基因组测序。项目组利用二代测序技术Illumina和三代单分子测序技术相结合,成功完成了高度杂合的丹参基因组组装,组装基因组大约641 M,contig和scaffold的N50分别为82.8 kb和1.2 Mb,并在基因组中预测到34,598个编码蛋白的基因和1,644独特的基因家族。研究论文“Hybrid de novo genome assembly of the Chinese herbal plant danshen (Salvia miltiorrhiza Bunge)”以我校张广辉副教授为第一作者发表于国际学术期刊GigaScience,最新公布的影响因子为7.463,论文链接http://gigascience.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13742-015-0104-3。基因组测序的完成为丹参新品种选育、药效成分生物合成分子机理研究等方面提供了重要的参考。丹参(Salvia miltiorrhiza)是我国重要的大宗中药材之一,主要治疗心脑血管疾病,以丹参为原料的药品有复方丹参滴丸、复方丹参片、冠心片、丹参注射液等。

      近年来,云南省优势中药材规范化种植工程研究中心围绕重要的药用植物资源,开展了大量研究,在国际刊物上发表了系列论文,其中两篇论文“Candidate genes involved in the biosynthesis of triterpenoidsaponins in Platycodongrandiflorum identified by transcriptome analysis”和“Excavation of Dipsacusasperoides unmasked both cryptic asperosaponin biosynthetic genes and SSR markers”发表于Frontiers in Plant Science,影响因子4.495;研究论文“Transcriptome analysis of Panaxvietnamensisvar. fuscidicus discovers putative ocotillol-type ginsenosides biosynthesis genes and genetic markers”,发表于BMC Genomics,影响因子3.867。这些研究成果阐明了药用成分生物合成分子机理,发现了大量的候选基因和分子标记。论文“Transcriptomic comparison of the self-pollinated and cross-pollinated flowers of Erigeron breviscapus to analyze candidate self-incompatibility-associated genes.”发表于BMC Plant Biology,影响因子3.631,这篇论文揭示菊科植物灯盏花自交不亲和分子机理,为灯盏花育种奠定了基础。


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